A tale of memories

Синдзи сообщает, что может уничтожить Nerv, если ему не объяснят происшедшее с Тодзи. Он зол на отца, но Гендо не собирается ему ничего объяснять и приказывает извлечь пилота из Евы-01.
После этого происшествия, Синдзи сообщает отцу, что не намерен больше пилотировать Еву, и покидает Nerv. В это время нападает Ангел. Синдзи прячется в убежище.
Пока Аска сражается с Ангелом, Рей пытается синхронизироваться с Евой-01, потому что Ева-00 еще не полностью восстановлена после предыдущего сражения. Но Ева-01 отторгает и Рей, и псевдопилота. Аска терпит поражение. Рей, управляя Евой-00, пытается взорвать и себя, и Ангела, но ей это не удается. Убежище, в котором прячется Синдзи, разрушено. В это время мальчика находит Кадзи и сообщает, что его раскрыли и отстранили от дел Nerv, а Синдзи еще может что-то изменить. Пилот возвращается в штаб.
Разрушив все защитные плиты, Ангел пытается уничтожить Центр, но Ева-01 под руководством Синдзи стремится остановить его. Ангел начинает разрушать Еву, но та пробуждается и самовосстанавливается. Она уничтожает и пожирает Ангела, стремясь заполучить его двигатель.